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SAXSpace系统 | 高效且稳定的SAXS研究_乐鱼全站APP - 官网登录
点击量: 435     作者: 乐鱼全站APP     时间: 2022-08-06 00:42:05

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用线准直丈量低浓度且易受辐射影响的生物样品的小角X-射线散射 (SAXS) ,可以确保短的丈量时候,而且获得知足阐发低分辩率的3D布局的崇高高贵数据质量。

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生物样品的SAXS

SAXS 可觉得生物样品,如卵白质、RNA、DNA和其复合物等在近乎天然状况的溶液前提下供给很是有价值的布局信息。可是,获得生物材料的高质量SAXS数据长短常复杂的,这是因为低样品浓度使得散射曲线信噪比低,而且样品不变性低。

线准直供给了降服这些挑战的怪异优势:

    比拟较在点准直,提高了信噪比

    杰出的样品不变性(没有辐射侵害而至的样品变性)

    高分辩率(例如,更小的散射矢量)和高通量以确保丈量时候短

    为了数乐鱼全站APP据解析和布局研究,利用尺度法式对线恍惚化的SAXS数据进行评估。

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    尝试和成果

    在这个研究中,将尝试室SAXS仪器线准直(封锁靶SAXSpace系统)与点准直(扭转阳极靶系统)丈量的lysozyme卵白溶液(5 mg/ml)的散射曲线进行比力。两个尝试的暴光时候和qmin是一样的。

    线准直测得的数据消恍惚后的1D散射曲线和对距离散布函数p(r)与点准直获得的完全符合(图1)。

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    图1:lysozyme的径向密度散布:理论与尝试数据比拟较

    利用GIFT1法式中IFT运算法例。

    消恍惚后的数据利用DAMMIF2法式,进行低分辩率模子的重建。如图2所示,晶体布局(PDB132I)明显与低分辩率的轮廓符合合。

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    图2:lysozyme和transportin-1低分辩率3D轮廓模子

    更进一步的SAXS数据在100 kDa 人类核转运受体transportin-1卵白浓度为8 mg/ml下记实。 如不雅察到的lysozyme,DAMMIF法式由线准直下测得的散射数据获得的低分辩率模子与晶体布局(PDB 4FDD)完全一致。这注解,利用线准直的获得的SAXS数据很好地合适在研究溶液中的生物样品。

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